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Physiopathologie et épidémiologie des maladies respiratoires

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Présentation

Les maladies respiratoires (asthme, broncho-pneumopathies chroniques obstructives -BPCO-, emphysème et fibrose pulmonaire), sont une cause majeure de morbidité et de mortalité en France et dans le monde. Ces maladies évoluent toutes, dans leurs formes sévères, vers l'insuffisance respiratoire, et l'arsenal thérapeutique actuellement disponible est largement insatisfaisant. L'insuffisance respiratoire liée à ces maladies résulterait d'un processus de remodelage tissulaire centré sur la bronche et/ou l'alvéole, dont les déterminants cellulaires et moléculaires seraient peu ou pas sensibles aux thérapeutiques conventionnelles. Ce remodelage est la conséquence d'une réparation tissulaire incomplète, ou anarchique en réponse à des agressions aigues ou chroniques. Le projet de l'Unité 700 est centré sur la recherche des facteurs environnementaux, personnels et biologiques responsables du remodelage bronchique et/ou alvéolaire conduisant à une insuffisance respiratoire sévère et irréversible dans les maladies bronchiques (asthme et BPCO), et alvéolaires (emphysème et fibroses pulmonaires). Les objectifs sont :

d'identifier les facteurs de susceptibilité personnels et environnementaux impliqués dans la constitution d'une insuffisance respiratoire ;
de définir les mécanismes qui contrôlent son initiation et sa progression ;
de rechercher des marqueurs cellulaires et moléculaires caractérisant plus précisément ce remodelage et sa relation avec les anomalies de la fonction respiratoire ;
de tester des nouvelles stratégies thérapeutiques préventives ou curatives visant à inhiber le remodelage pulmonaire et les anomalies fonctionnelles respiratoires qui l'accompagnent.

Equipes de recherche

Equipe 1 : Epidemiologie des allergies respiratoires et des bpco : etiologie, histoire naturelle et prise en charge

Equipe 2 : Mecanismes cellulaires et moleculaires du remodelage bronchique dans l'asthme severe et la bpco

Equipe 3 : Inflammation et fibrogenese pulmonaires.

Equipe 4 : Immunité Innée et défenses pulmonaires anti-infectieuses - voir aussi l'UFR Sciences du Vivant

[hal-01927078] [PD-L1 testing in non-small cell lung carcinoma: Guidelines from the PATTERN group of thoracic pathologists].

Date: 19 Nov 2018 - 15:55

Desc: Lung cancer is the leading cause of cancer death in France with low response rates to conventional chemotherapy. Nevertheless, new therapies have emerged recently, among which PD1 immune checkpoint inhibitors (ICI), such as nivolumab (OPDIVO®, Bristol-Myers Squibb) and pembrolizumab (KEYTRUDA®, Merck & Co), or PD-L1 ICI, such as atezolizumab (TECENTRIQ®, Genentech), durvalumab (IMFINZI®, Astra-Zeneca), and avelumab (BAVENCIO®, EMD Serono). The prescription of pembrolizumab for advanced stage non-small cell lung carcinoma (NSCLC) patients requires the demonstration of PD-L1 expression by tumor cells by immunohistochemistry (IHC) (minimum of 50% of positive tumor cells is required for first-line setting, and of 1% for second-line and beyond) and PD-L1 assay is now considered as a companion diagnostic tool for this drug. Numerous standardized PD-L1 assays performed on dedicated platforms have been validated in clinical trials, each antibody being associated to one specific PD1 or PD-L1 inhibitor. However, not all pathologists have access to the dedicated platforms and the high cost of these assays is still a limitation to their implementation; in addition, the small size of the NSCLC tumor samples does not allow to perform at the same time multiple assays for multiple drugs. The use of laboratory-developed tests seems feasible but their validation must guarantee the same sensitivities and specificities as standardized tests. In this context, the French group of thoracic pathologists PATTERN has teamed up with thoracic oncologists to provide recommendations on the indication, the critical technical steps and the interpretation of the PD-L1 IHC test to help pathologists to implement quickly and in the best conditions this new theranostic test.

[hal-03577395] Impact of combined antibiotic treatment on multidrug-resistant bacteria emergence after postoperative intra-abdominal infections

Date: 16 Feb 2022 - 16:37

Desc: [...]

[inserm-01814823] Association between air pollution and rhinitis incidence in two European cohorts

Date: 13 Jun 2018 - 16:29

Desc: BACKGROUND: The association between air pollution and rhinitis is not well established. AIM: The aim of this longitudinal analysis was to study the association between modeled air pollution at the subjects' home addresses and self-reported incidence of rhinitis. METHODS: We used data from 1533 adults from two multicentre cohorts' studies (EGEA and ECRHS). Rhinitis incidence was defined as reporting rhinitis at the second follow-up (2011 to 2013) but not at the first follow-up (2000 to 2007). Annual exposure to NO2, PM10 and PM2.5 at the participants' home addresses was estimated using land-use regression models developed by the ESCAPE project for the 2009-2010 period. Incidence rate ratios (IRR) were computed using Poisson regression. Pooled analysis, analyses by city and meta-regression testing for heterogeneity were carried out. RESULTS: No association between long-term air pollution exposure and incidence of rhinitis was found (adjusted IRR (aIRR) for an increase of 10 μg·m-3 of NO2: 1.00 [0.91-1.09], for an increase of 5 μg·m-3 of PM2.5: 0.88 [0.73-1.04]). Similar results were found in the two-pollutant model (aIRR for an increase of 10 μg·m-3 of NO2: 1.01 [0.87-1.17], for an increase of 5 μg·m-3 of PM2.5: 0.87 [0.68-1.08]). Results differed depending on the city, but no regional pattern emerged for any of the pollutants. CONCLUSIONS: This study did not find any consistent evidence of an association between long-term air pollution and incident rhinitis.

[tel-01137236] Les fonctions non-apoptotiques et pro-fibrosantes de la protéine pro-apoptotique BAX dans la fibrose pulmonaire idiopathique

Date: 30 Mar 2015 - 19:23

Desc: Nous nous intéressons aux mécanismes moléculaires impliqués dans la physiopathologie de la fibrose pulmonaire idiopathique. La fibrose pulmonaire estcaractérisée par l’accumulation de protéines de la matrice extracellulaire et de fibroblastes dans les espaces aériens distaux. La désorganisation et la destructionalvéolaires qui résultent de la fibrose aboutissent à une altération des propriétés mécaniques du poumon et à une incapacité à réaliser les échanges gazeux responsables d’une insuffisance respiratoire parfois mortelle. Le pronostic de la fibrose pulmonaire idiopathique (FPI) est particulièrement mauvais puisque la médiane de survie est de 3 à 5 ans. Il n’existe actuellement aucune thérapeutique efficace dans la fibrose pulmonaire. Ainsi, il est crucial d’explorer de nouvelles hypothèses physiopathologiques dans cette maladie afin d’ouvrir de nouvelles voies thérapeutiques. L'apoptose joue un rôle clé dans le développement de nombreux organes et dans l'homéostasie tissulaire chez l'adulte. Les protéines de la famille BCL-2 sont des éléments essentiels de la machinerie apoptotique. Ces protéines agissent comme des régulateurs anti- ou pro-apoptotiques. Parmi les membres de la famille BCL-2, le facteur pro-apoptotique BAX contrôle la voie mitochondriale de l’apoptose. Des perturbations de l’apoptose ont été mises en cause dans des maladies pulmonaires comme la fibrose pulmonaire idiopathique. Des études récentes suggèrent fortement que les protéines de la famille BCL-2 sont également impliquées dans d’autres fonctions cellulaires que le contrôle de l'apoptose. De plus, la protéine BAX est aussi localisée dans le noyau de nombreux types cellulaires. Même si le rôle de la fraction cytoplasmique de BAX au cours de l’apoptose est assez bien caractérisé, les fonctions nucléaires de BAX ne sont pas connues. Ce travail de thèse a pour but de mieux comprendre le rôle de la forme nucléaire de BAX dans différents processus cellulaires fondamentaux impliqués dans la fibrogenèse. Notre étude montre que la protéine BAX est présente dans le noyau à proximité de l’euchromatine dans différentes lignées d’origine pulmonaire in vitro. Ensuite, nous montrons que la forme nucléaire de BAX est impliquée dans la progression du cycle cellulaire et dans le contrôle de l’état de différenciation myofibroblastique en condition basale. Enfin, nous avons détecté la forme nucléaire de BAX dans l’épithélium hyperplasique et les foyers de fibrose dans le poumon de FPI.

[inserm-01460725] Potential importance of protease activated receptor (PAR)-1 expression in the tumor stroma of non-small-cell lung cancer

Date: 7 Feb 2017 - 18:05

Desc: AbstractBackgroundProtease activated receptor (PAR)-1 expression is increased in a variety of tumor cells. In preclinical models, tumor cell PAR-1 appeared to be involved in the regulation of lung tumor growth and metastasis; however the role of PAR-1 in the lung tumor microenvironment, which is emerging as a key compartment in driving cancer progression, remained to be explored.MethodsIn the present study, PAR-1 gene expression was determined in lung tissue from patients with non-small-cell lung cancer (NSCLC) using a combination of publicly available RNA microarray datasets and in house-made tissue microarrays including tumor biopsies of 94 patients with NSCLC (40 cases of adenocarcinoma, 42 cases of squamous cell carcinoma and 12 cases of other type of NSCLC at different stages).ResultsPAR-1 gene expression strongly correlated with tumor stromal markers (i.e. macrophage, endothelial cells and (myo) fibroblast markers) but not with epithelial cell markers. Immunohistochemical analysis confirmed the presence of PAR-1 in the tumor stroma and showed that PAR-1 expression was significantly upregulated in malignant tissue compared with normal lung tissue. The overexpression of PAR-1 in tumor stroma of NSCLC appeared to be independent from tumor type, tumor stage, histopathological differentiation status, disease progression and patient survival.ConclusionOverall, our data provide evidence that PAR-1 in NSCLC is mainly expressed on cells that constitute the pulmonary tumor microenvironment, including vascular endothelial cells, macrophages and stromal fibroblasts.